Adından da anlaşılacağı gibi soya bazlı mürekkep soya fasulyesinden yapılır. Kullanılan reçineler ve mumlar da mürekkebi son derece çevre dostu ve biyolojik olarak parçalanabilir hale getiren doğal katkı maddeleridir. Mürekkebin en az %6-40'ı soyadan oluşuyorsa mürekkep soya bazlı kabul edilir. Öte yandan petrol bazlı mürekkep ham petrolden yapılır. Bu tür mürekkepler toksiktir, yanıcıdır ve kuruduğunda uçucu organik bileşikler yayar.
